Diagnòstic molecular coagulopaties congènites per NGS: Dèficit de Factor II
Codi: LRD2833
Informació clínica
Utilitat diagnòstica:
Identificar el defecte molecular al F2 en pacients diagnosticats de DFII.
Dèficit de Factor II (DFII)
El DFII, també conegut com a dèficit de protrombina, és un trastorn hemorràgic causat per una reducció de l'activitat del factor II (FII, protombina) i caracteritzat per manifestacions hemorràgiques mucocutànies. Aquest dèficit té una prevalença de 1/2.000.000. Afecta per igual a ambdós sexes i pot manifestar-se a qualsevol edat, tot i que en general, les formes greus es manifesten de forma primerenca. Es distingeixen dos fenotips principals: hipoprotrombinèmia amb disminució de l'activitat i nivell d'antigen i disprotrombinèmia amb síntesi normal però amb una proteïna disfuncional. Les manifestacions clíniques més freqüents inclouen: epistaxi, menorràgia, hemorràgies a la cavitat bucal, sagnat de les mucoses, sagnat en els teixits tous, hemartrosi, fàcil aparició de blaus i sagnat prolongat després d'una extracció dental, trauma o cirurgia. La gravetat de les manifestacions hemorràgiques està correlacionada amb els nivells de FII.
El DFII presenta una herència autosòmica recessiva i està causat per mutacions en el gen F2 (F2), que codifica per la protrombina. S'han detectat més de 50 mutacions que causen aquesta deficiència. Algunes mutacions redueixen dràsticament l'activitat de la protrombina i poden provocar episodis de sagnat sever. Altres mutacions permeten una quantitat moderada d'activitat, que generalment causa episodis de sagnat lleu. No obstant, cap de les mutacions identificades elimina la funció total de la protrombina.
Aplicació d'un panell de múltiples gens que es basa en l'amplificació simultània dels exons i les regions intròniques flanquejants per a la seva seqüenciació mitjançant tècniques de seqüenciació massiva (NGS) i permet realitzar l'estudi molecular simultani dels gens relacionats amb les coagulopaties congènites i trastorns hemorràgics hereditaris entre els quals es troba el gen del Factor II (F2).
Mètode:
Seqüenciació massiva (NGS)
Seqüenciació massiva dels exons i les regions intròniques flanquejants del F2 amb l'aplicació d'un panell de gens relacionats amb les coagulopaties congènites.
Seqüenciació tradicional de Sanger per comprovar la/es mutació/ns detectades per NGS en els pacients diagnosticats amb DFII, per tal d'arribar a un resultat inequívoc, analitzant la regió concreta on es troba la variant.
En el cas de no identificar cap mutació potencial o definitivament causant de la patologia s'informarà i discutirà amb l'equip mèdic demandant de la prova la possibilitat de realitzar estudis complementaris.
Valors de referència
No aplica
Algoritme diagnòstic:
No aplica
Temps de resposta:
20 dies laborables
Informació sobre l’espècimen
Mostra: Sang total
Tub: Tub EDTA K3 5-10 ml si es tracta d'una mostra de sang
Volum mínim imprescindible: 3 ml
Estabilitat:
- A temperatura ambient: 4 dies
- En refrigeració: 10 dies
Instruccions de transport: Preferiblement a temperatura ambient
Motiu de rebuig: Mostra coagulada i/o incorrectament identificada.
Altres tipus de mostres acceptades:
- DNA purificat, mínim 300 ng (30 ng/µL)
- Mucosa bucal: contactar amb el laboratori per consultar especificacions de recollida de la mostra.
Informació administrativa
Codi BST: LRD2833
Descripció de la prova: Diagnòstic molecular de coagulopaties congènites per NGS: Dèficit de Factor II.
Sinònims: Estudi genètic del DFII, estudi molecular de la protrombina, seqüenciació del F2.
Secció: Coagulopaties Congènites
Tarifa BST: Consultar les tarifes actualitzades aquí.
En el full de petició d'estudi molecular s'ha de marcar la casella DFII i omplir les dades fenotípiques de les que es disposi.
Perfils:
No aplica.
Referències
- Peter J Hulick. Next-generation DNA sequencing (NGS): Principles and clinical Applications. Waltham, MA: UpToDate Inc. https://www.uptodate.com
- DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis. Applied Biosystems Chemistry Guide. Second Edition.
Base de dades de mutacions
- Human Gene Mutation Database: http://www.hgmd.cf.ac.uk
- EAHAD Coagulation Factor Variant Databases: https://databases.lovd.nl/shared/genes/F2
Qualitat
El BST té les certificacions de qualitat ISO 9001, ISO 14001, OSHAS 18001 i el segell d'Excel·lència Europea 500+. El BST està acreditat per CAT, JACIE-FACT, FACT-NETCORD i EFI, compleix les directrius de les Normes de Correcta Fabricació i les Normes de Correcta Distribució.
