Diagnòstic molecular coagulopaties congènites per NGS: Dèficit Combinat de Factor V i Factor XIII
Codi: LRD2833
Informació clínica
Utilitat diagnòstica:
Identificar el defecte molecular als gens LMAN1 i MCFD2 en pacients diagnosticats de DFVFVIII.
Dèficit Combinat dels factors V i VIII (DFVFVIII)
El DFVFVIII és un trastorn causat per la disminució dels nivells d'activitat i d'antigen tant del factor V (FV) com del factor VIII (FVIII) i caracteritzat per símptomes d'hemorràgics de lleus a moderats. La prevalença s'estima entre 1/100.000 i 1/1.000.000. Aquesta patologia és més freqüent a la zona mediterrània i a les zones on són habituals els matrimonis consanguinis. Els símptomes més freqüents són epistaxis, contusió fàcil, hemorràgia post-quirúrgica o post part i menorràgia. Es poden produir hemartrosi i hematomes musculars. Els símptomes solen ser lleus. Els nivells dels factors V i VIII varien entre el 1-46% i presenten manifestacions d'hemorràgia lleu a moderada, debutant a qualsevol edat.
El DFVFVIII presenta una herència autosòmica recessiva i està causat per mutacions en els gens MCFD2 i LMAN1, que codifiquen per proteïnes implicades en el transport intracel·lular del FV i el FVIII. El 70% de les mutacions afecten al LMAN1, mentre que el 30% restant afecten al MCFD2.
Aplicació d'un panell de múltiples gens que es basa en l'amplificació simultània dels exons i les regions intròniques flanquejants per a la seva seqüenciació mitjançant tècniques de seqüenciació massiva (NGS) i permet realitzar l'estudi molecular simultani dels gens relacionats amb les coagulopaties congènites i trastorns hemorràgics hereditaris entre els quals es troben els gens del Dèficit Combinat de FV i FVIII (MCFD2; LMAN1).
Mètode:
Seqüenciació massiva dels exons i les regions intròniques flanquejants del LMAN1 i MCFD2 amb l'aplicació d'un panell de gens relacionats amb les coagulopaties congènites.
Seqüenciació tradicional de Sanger per recomprovar la/les mutació/ns detectades per NGS en els pacients diagnosticats amb DFVFVIII, per tal d'arribar a un resultat inequívoc, analitzant la regió concreta on es troba la variant.
En el cas de no identificar cap mutació potencial o definitivament causant de la patologia s'informarà i discutirà amb l'equip mèdic demandant de la prova la possibilitat de realitzar estudis complementaris.
Valors de referència
No aplica
Algoritme diagnòstic:
No aplica
Temps de resposta:
30 dies laborables
Informació sobre l’espècimen
Mostra: Sang total
Tub: Tub EDTA K3 5-10 ml si es tracta d'una mostra de sang
Volum mínim imprescindible: 3 ml
Estabilitat:
- A temperatura ambient: 4 dies
- En refrigeració: 10 dies
Instruccions de transport: Preferiblement a temperatura ambient
Motiu de rebuig: Mostra coagulada i/o incorrectament identificada.
Altres tipus de mostres acceptades:
- DNA purificat, mínim 300 ng (30 ng/µL)
- Mucosa bucal: contactar amb el laboratori per consultar especificacions de recollida de la mostra.
Informació administrativa
Codi BST: LRD2833
Descripció de la prova: Diagnòstic molecular de coagulopaties congènites per NGS: Dèficit Combinat del factor V i VIII.
Sinònims: Estudi genètic del DFVFVIII, seqüenciació del LMAN1 i MCFD2.
Secció: Coagulopaties Congènites
Tarifa BST: Consultar les tarifes actualitzades aquí.
En el full de petició d'estudi molecular s'ha de marcar la casella DFV+DFVIII i omplir les dades fenotípiques de les que es disposi.
Perfils:
No aplica.
Referències
- Peter J Hulick. Next-generation DNA sequencing (NGS): Principles and clinical Applications. Waltham, MA: UpToDate Inc. https://www.uptodate.com
- DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis. Applied Biosystems Chemistry Guide. Second Edition.
Base de dades de mutacions
- EAHAD Coagulation Factor Variant Databases: https://databases.lovd.nl/shared/genes/LMAN1; https://databases.lovd.nl/shared/genes/MCFD2
- Human Gene Mutation Database: http://www.hgmd.cf.ac.uk
Qualitat
El BST té les certificacions de qualitat ISO 9001, ISO 14001, OSHAS 18001 i el segell d'Excel·lència Europea 500+. El BST està acreditat per CAT, JACIE-FACT, FACT-NETCORD i EFI, compleix les directrius de les Normes de Correcta Fabricació i les Normes de Correcta Distribució.