Diagnòstic molecular coagulopaties congènites per NGS: Dèficit d’antitrombina III
Codi: 70837
Informació tècnica
Utilitat
Identificar el defecte molecular al SERPINC1 en pacients diagnosticats de DATIII.
Dèficit d'Antritrombina III (DATIII)
La trombofília hereditària per dèficit d'antitrombina és una malaltia hematològica, poc freqüent, caracteritzada per nivells disminuïts d'activitat antitrombina en plasma, cosa que dóna com a resultat una alteració de la desactivació de la trombina i del factor Xa. Al voltant del 50% dels afectats presenten tromboembolisme venós, generalment de les venes profundes de braços, cames i sistema pulmonar.
El dèficit d'antitrombina de tipus I (quantitatiu i qualitatiu) correspon al 12% dels casos, mentre que la de tipus II (qualitatiu) representa el 88% del total de pacients.
El dèficit d'antitrombina III presenta una herència autosòmica dominant i una prevalença de al voltant del 0,2 al 0,4%. Està causat per mutacions en heterozigosi al gen SERPINC1, que codifica per l'antitrombina. La presència de mutacions en homozigosi seria incompatible amb la vida.
Aplicació d'un panell de múltiples gens que es basa en l'amplificació simultània dels exons i les regions intròniques flanquejants per a la seva seqüenciació mitjançant tècniques de seqüenciació massiva (NGS) i permet realitzar l'estudi molecular simultani dels gens relacionats amb les coagulopaties congènites i trastorns hemorràgics hereditaris entre els quals es troba el gen de l'Antritrombina III. (SERPINC1).
Mètode
Seqüenciació massiva (NGS) dels exons i les regions intròniques flanquejants del SERPINC1.
Seqüenciació tradicional de Sanger per comprovar la/les mutació/ns detectades per NGS en els pacients diagnosticats amb DATIII, per tal d'arribar a un resultat inequívoc, analitzant la regió concreta on es troba la variant.
En el cas de no identificar cap mutació potencial o definitivament causant de la patologia s'informarà i discutirà amb l'equip mèdic demandant de la prova la possibilitat de realitzar estudis complementaris.
Valors de referència
No aplica.
Algoritme diagnòstic
No aplica.
Temps de resposta
30 dies laborables.
Informació sobre l’espècimen
Mostra: Sang total
Tub: Tub EDTA K3 5-10 ml si es tracta d'una mostra de sang
Volum mínim imprescindible: 3 ml
Estabilitat:
-
A temperatura ambient: 4 dies
-
En refrigeració: 10 dies
Instruccions de transport: Preferiblement a temperatura ambient
Motiu de rebuig: Mostra coagulada i/o incorrectament identificada.
Altres tipus de mostres acceptades:
-
DNA purificat, mínim 300 ng (30 ng/μL).
-
Mucosa bucal: contactar amb el laboratori per consultar especificacions de recollida de la mostra.
Informació administrativa
Codi BST: 70837
Codi BST antic: LRD2833
Descripció de la prova: Diagnòstic molecular de coagulopaties congènites per NGS: Dèficit d'Antritrombina III.
Sinònims: Estudi genètic de DATIII, seqüenciació del SERPINC1.
Secció: Coagulopaties Congènites.
Tarifa BST: Consultar les tarifes actualitzades aquí.
En el full de petició d'estudi molecular s'ha de marcar la casella DATIII i omplir les dades fenotípiques de les que es disposi.
Perfils: 70837
Referències
-
Peter J Hulick. Next-generation DNA sequencing (NGS): Principles and clinical Applications. Waltham, MA: UpToDate Inc. https://www.uptodate.com
-
DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis. Applied Biosystems Chemistry Guide. Second Edition.
Base de dades de mutacions
-
EAHAD Coagulation Factor Variant Databases: https://databases.lovd.nl/shared/variants/SERPINC1
-
Human Gene Mutation Database: http://www.hgmd.cf.ac.uk